подскажите. как лучше сделать

[kashperuk]

Нет, подоход, конечно чем-то верен. Но реализация, имхо, хромает.
Уже есть таблица, куда сохраняются пользовательские настройки - SysLastValue
Эти ваши галки - какой ключ в Map? Используется RecId?
Сделайте новый Set из этих RecId.

Дальше посмотрите туториал форму tutorial_SysLastValue, создайте на вашей форме требуемые методы, и в методе pack() упаковывайте созданный Set
Потом при открытии формы, после unpack() проставляйте галки по этому Set.

Единственное, как быть со значениями из Map? Они тоже должны сохраняться?