1. Во всех классах изменения не сохраняются?
2. К примеру, в методах на таблицах код дает сохранить?
3. Новые классы сздаются, сохраняются?
Возможно, у вас нет лицензии на разработку

И еще почему то контроль версий в голове крутится, но где вырубается - не помню.