Судя по проводкам аксапта сделала все логично и правильно.
Скидки налогами не облагаются.
Сумма выручки, подлежащие налогообложению НДС, определяется с учетом скидки.
Если вы посчитаете выручку без налогов от сделки то получите именно то провела по проводкам Аксапта.
__________________
|